In Memmingen und Kempten sind die Johanniter im Katastrophenschutz aktiv. Wenn bei Hochwasser ganze Landstriche überflutet werden, Deiche brechen und Wassermassen Straßen und Häuser verwüsten, sind die ehrenamtlichen Katastrophenhelfer zur Stelle. Sie stehen schnell und kompetent bereit, wenn bei Großschadensereignissen die örtlichen Kapazitäten nicht mehr ausreichen. Hierfür steht ein umgebauter Unimog in Memmingen einsatzbereit. Ein Unimog für Kempten befindet sich noch in der Umbauphase.
Außerdem stellen die Johanniter vor Ort Schnelleinsatzgruppen zusammen. Wenn bei größeren Unfällen viele Verletzte versorgt werden müssen braucht der Rettungsdienst Unterstützung. Die Einheiten des Katastrophenschutzes sind hierfür zu schwerfällig. Die Lücke wird geschlossen durch Schnelleinsatzgruppen: Kleine flexible Einheiten, die Tag und Nacht schnell helfen können.